Il convient de distinguer deux catégories de maladies :
- les maladies qui sont présumées avoir été contractées dans le cadre du travail, sous réserve de respecter les conditions fixées (désignation, délai de prise en charge et liste limitative des travaux pouvant provoquer ces maladies) ;
- les maladies qui ne sont pas présumées avoir été contractées dans le cadre du travail, mais peuvent être reconnues d'origine professionnelle sous réserve d'un avis motivé du comité régional de reconnaissance des maladies professionnelles, établissant le lien entre la maladie et le travail et que la maladie ait entraîné le décès ou une incapacité permanente de travail d'au moins 25 %.
La procédure de reconnaissance des maladies professionnelles, tout comme celle des accidents du travail, a été modifiée par le décret n° 2019-356, du 23 avril 2019, relatif à la procédure d'instruction des déclarations d'accidents du travail et de maladies professionnelles du régime général.
L'objectif de cette réforme d'ampleur était d'encadrer et sécuriser la procédure d'instruction des déclarations AT-MP d'une part et, d'autre part, de définir les règles conduisant au respect du contradictoire.
Cette réforme est venue créer une section, regroupant les dispositions communes aux accidents du travail et maladies professionnelles.
