La gestion d'une pharmacie implique les mêmes questions qui peuvent se poser pour une société (si une société a été créée pour l'exploiter) et pour un fonds de commerce.
Tout au long de la vie de son officine, le pharmacien va ainsi être confrontée à des questions d'ordre commerciale, comme lors d'une cession, des questions relatives au droit du travail s'il a des employés, ou encore de baux commerciaux s'il ne détient pas les murs.
La gestion d'une société peut également entrainer certaines difficultés, selon la forme juridique mise en place (SNC, SARL, SEL, ...) : gestion habituelle de la société, conflits entre les associés, redistribution des bénéfices, ...
